Enligt Adler Salvius ofvannämnda förslag år 1636 till instruktion för amiralitetskollegum skulle folk och skepp fördelas på tre regementen, af hvilka ett under riksamiralen och de andra under hvardera af de båda amiralerna af rikets råd. Af de år 1640 uppsatta tolf kompanierna bildade tre båtsmans- och ett bösseskyttar kompani tillhopa ett regemente.
Territorialfördelningen mellan regementena var hufvudsakligen sådan, att kusten söder om Stockholm tillhörde 1:a regementet, norr om Stockholm det 2:a samt Åland och Finland det 3:e. Åren 1635—1644 innehades 1:a regementet af riksamiralen, det 2:a af amiral Erik Ryning och det 3:e af amiral Klas Fleming. Kompaniernas fördelning på regementen inhemtas närmare af en förteckning å kompanicheferna bil. 3.
Dessa tillsattes af amiralitetskollegium. I regel skulle de vara kaptener, nemligen skeppskapten för båtsmanskompani och artillerikapten för bösseskyttarkompani, men härifrån skedde många undantag. Löjtnanter erhöllo ibland kompanier och kaptenerna fingo vanligen behålla dem äfven sedan de befordrats till flaggmän. Blott undantagsvis erhöllo de, som redan voro flaggmän, kompanier, såsom major Ture Turesson (Natt och Dag) år 1658, major Klas Uggla 1660 och major Krister Boije 1666. Denne sistnämnde erhöll kompani, ehuru amiralitetskollegium året förut beslutat, att “ingen amirallöjtnant eller major skall härefter hafva något kompani, utan kaptener och löjtnanter, som bäst hafva tid att nappas dermed.“[1]
Kompanichefernas instruktioner innehållas i deras
fullmagter eller förordnanden. De äro hvarandra temligen lika.
Kompanichef skulle:
hålla kompaniet komplett och låta rotarne sätta ny karl
i den afgångnes ställe;
tillse att folket får sitt hemkall efter ordningen;
vaka öfver att kompani-lodjorna äro i fullgodt skick; samt
vid uppfordring på Skeppsholmen tillse att folket är
tillstädes vid arbetena och för detta ändamål besöka dem minst
två gånger om dagen. Deremot förbjudes kompanichef
strängeligen att hemförlofva, än mindre förpassa ur tjensten eller
förbyta någon karl utan amiralitetskollegiets order.[2]